CADCOM/MANUEL D'UTILISATION
La recherche de conformations
Rotation aléatoire des diédres
Cette technique utilise les méthodes de (Monte-Carlo).
et du (Recuit Simulé).
Une température initiale doît être fixée pour être
refroidie suivant un pas donné.
Le programme tourne de façon aléatoire les diédres
choisis(au minimum 3),calcule l'energie et analyse
la structure(suivant le critére de Métropolis).
Si son énergie est inférieure à l'énergie calculée
précédemment,le programme accepte la nouvelle
conformation et tourne à nouveau les liaisons.
Si l'énergie est supérieure,le programme calcule
la probabilité Pb(Boltzman)à la température choisie.
-si Pb.gt eca;acceptation
-si Pb.lt.eca;rejet
Toutes les structures trouvées sont stockées dans un fichier
pour être ensuite minimisées et comparées par superposition
géométrique.
Cette approche donne de bons résultats pour les
molécules acycliques et le cycles n'excédant pas
10 atomes.
2)Le déplacement aléatoire des atomes
Une autre approche au probléme du minimum local
consiste à déplacer les atomes non terminaux de façon
aléatoire à l'intérieur d'une sphére (de rayon défini
par l'utilisateur).
Aprés minimisation,si l'énergie se trouve dans la
fenêtre d'énergie préalablement fixée par l'utilisateur,
la conformation est stockée et est à nouveau randomisée
et minimisée.
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revised:05/2000