CADCOM/MANUEL D'UTILISATIONLa structure 3D d'une molécule résulte des interactions intramoléculaires et des interactions avec le solvant. La recherche des conformations consiste donc à déterminer les minimas de l'énergie globale d'interaction qui en général est réduite aux interactions intramoléculaires. La surface d'énergie d'une molécule peût être approchée à l'aide de la fonction analytique suivante: E = Estretching (Etirement) + Ebending (Flexion dans le plan) + Etorsion (Torsion) + Evdw (Van der Vaals) + Eelec (Electrostatique) + Ehydrogen (Liaisons Hydrogéne) Chacun de ces termes est représenté par une fonction analytique dont les constantes ont été déterminées empiriquement. Le terme "Stretching" représente l'élongation des liaisons Le terme "Bending" représente la variation des angles . Le terme "Torsion" se rapporte à l'énergie de torsion des angles dièdres. Le terme "Vdw" rend compte des énergies d'interaction entre atomes non liés. Le terme "Elec" rend compte des énergies d'interaction électrostatiques entre atomes non liés. Le terme "Hydrogen" rend compte des liaisons Hydrogéne. Tous les termes ci-dessus se décrivent sous la forme Ks(r-r0) ou Kø(Ø-Ø0)..Ks,Kø sont appelées constantes de force. Ces constantes dépendent bien sûr du type d'atome,mais aussi de leur environnement.La liste compléte de ces constantes est appelée CHAMPS DE FORCE Lorsque la molécule a été dessinée,que les types d'atomes ont été reconnus par le champs de force,que les liaisons ont été correctement définies(vérification de la valence et de la logique chimique).., on passe à la deuxiéme étape qui est la Minimisation de son energie
LA MECANIQUE MOLECULAIRE
Webmaster:
Last revised:05/2000