CADCOM/MANUEL D'UTILISATION
 
       f) la liaison Hydrogéne
          pour maximiser la liaison Hydrogéne,on définit 2
           facteurs de contribution:
             -les interactions charge-charge(qq),ou les charges
              sont dérivées des dipôles de liaison de la
              molécule,incluant la liaison atome_doublet.
             - un terme en attraction en 1/r2 entre le doublet
              (dont le rayon vdw est fixé à 0.2Ang) et l'atome
               d'hydrogéne
           Donc,tout atome susceptible d'accepter la liaison H
           requiert des doublets avec des moments de liaison
           reproduisant les moments dipolaires et contribuant
           à la liaison H. Ces atomes sont
                 -les oxygénes(type 6,7,42)
                 -les azotes(type 8,10,37)
                 -le soufre (type 15)
                 -le phosphore  (type25)
 
           Les moments dipolaires des doublets sont utilisés
           pour les hydrogénes type 21,23,24,28 et l'hydrogéne
           type 5 quand il est relié au soufre.
           Le potentiel d'interaction (1/r²)dépend de la
           basicité des doublets donneurs et de l'acidité
           de l'hydrogéne.
           Il y a également une dépendance angulaire dans la
           terme 1/r² qui est du type k*(Rij-R:h)**3
              Rij= distance entre l'atome donneur de
                   doublets et l'atome donneur d'hydrogéne
              R:h= distance entre le doublet et l'Hydrogéne
 
          Le potentiel d'interaction VDW entre un Hydrogéne et
          un doublet est donc donné par la formule suivante:
           Evdw=eps*290000*e(-12.5/p)-ehb*p²
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

 



Webmaster:

Last revised: