CADCOM/MANUEL D'UTILISATION
 
 
 
LE POTENTIEL DE LIPOPHILIE MOLECULAIRE
 
 
 

1) Définition du PLM
   Les méthodes traditionnelles donnent une valeur 1D du Logp
   en ce sens qu'elles fournissent des informations limitées
   et insuffisantes lorsqu'il s'agit d'analyser la structure
   dans l'espace et notamment d'étudier les interactions
   moléculaires.
   Le potentiel de lipophilie moléculaire de DUBOST et KUMMER
   est une approche originale permettant de définir des zones
   lipophiles et hydrophiles dans l'espace en associant le
   potentiel de lipophilie à la notion de probabilité de
   présence de ce potentiel.
 
 
         Si on considére une molécule S comme un ensemble
         de n fragments indépendants i,il est possible de
         quantifier la lipophilie de ces différents fragments
         au moyen de constantes hydrophobes fi.
 
         Lorsque cette molécule est plaçée au sein d'une phase
         constituée de molécules apolaires ou peu polaires L,
         leur disposition aléatoire à une certaine distance
         relativement importante de S va se trouver modifiée
         au fur et à mesure que cette distance diminue.
         En effet,les fragments lipophiles constitutifs de S
         ont tendance à attirer les molécules L alors que
         les fragments hydrophiles les repoussent.L'arrangement
         des molécules L autour de S et l'apparition des
         liaisons intermoléculaires de type hydrophobe sont
         donc fonction des différentes valeurs des constantes
         fragmentales fi et des distances di ,exprimées en Ang,
         séparant L de chaque fragment i.
         Celà peut se traduire de façon quantitative en
         définissant ,en tout point M entourant S ,un potentiel
         de lipophilie moléculaire(PLM) de la façon suivante:
 
         ou G(di) est une fonction directe de la distance de M 
         à chaque atome.

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Last revised:05/2000