CADCOM/MANUEL D'UTILISATION

RIX:RESEAU IMMUNITAIRE ARTIFICIEL

Présentation des données
 
 Le fichier de données à classer se compose donc de ny antigenes(ny étant
le nombre de lignes/observations/molecules...).
Chaque antigene est un vecteur de nx variables(descripteurs/colonnes).
Sa longueur est notée l.

Creation de la librairie d'anticorps
Initialement,notre librairie contiendra n1 anticorps de longueur l.
La valeur de chaque composante de ce vecteur est bien sûr tirée aléatoirement(entre 0 et 1).

Paramétres initiaux
    Metric(Choix de la métrique)
    Maxgen(nbr d'iterations/générations max)
    N1(nbr d'anticorps initiaux)
    Nselect(nbr d'anticorps selectionnes por clonage)
    T_hm(Taux d'hypermutation)
    Qi(% de clones selectionnés)
    Ts(Seuil de suppression des clones"mort naturelle")
    Tp(Seuil de "pruning")

Clonage et selection clonale
 
     Stimulation des anticorps
     La stimulation d'un anticorps est fonction directe de sa distance à l'antigene.
     On peut utiliser la formule  simple suivante.
      Stimulation = 1.0 -d(ag-ab)
     (plus la fonction stimulation est proche de 1.0 plus l'anticorps est proche de l'antigene)
    Les anticorps sont ainsi classés en fonction de leur stimulation
     Clonage
    Chaque N select anticorps va générer un nombre de clones(fonction de sa stimulation).
      Hypermutation des clones("maturation") 
    Ces clones vont profilérer en "hypermutant" suivant le principe suivant.
    Plus la stimulation des clones est élevée moins il hypermute.
    Plus la stimulation des clones est faible plus il hypermute.
     Sélection 
     Elle consiste à recalculer les distances entre clones et antigenes suivant la même métrique,
     à classifier les clones suivant leur stimulation.
     On sélectionne ensuite les Qi clones les plus stimulés pour les stocker dans la mémoire.
     

(SOMMAIRE)

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