ANALYSE FACTORIELLE DES CORRESPONDANCES
THEORIE DE L 'AFC
L'Analyse factorielle des correspondances (AFC) est une méthode récente développée par J.P Benzécri. Elle s'appuie sur la même logique que l'ACP. La distance utilisée est celle du Chi2. Les données d'entrée ne devant pas être négatives,le programme propose un prétraitement systématique-la base 100-,spécialement adapté à la modélisation moléculaire. Le programme calcule,comme en ACP,la matrice ds covariances, la diagonalise et en extrait les valeurs et vecteurs propres. Ce qui est intéressant dans l'ACF ,c'est que les données des colonnes(les descripteurs) et des lignes(les molécules) sont interchangeables,alors qu'en ACP on ne travaille que l'ensemble des colonnes. L'ACF a un autre avantage ,c'est d'étudier la proximité entre les 2 nuages de points(colonnes et lignes) Cette méthode est la meilleure façon de visualiser et d'interpréter les corrélations entre variables. Le programme représente en projection multi-axes: . le nuage des colonnes(descripteurs) . le nuage des lignes(molécules) ..et la superposition des 2 nuages Ce qui nous permet de mieux comprendre les attractions et les répulsions entre descripteurs et molécules. Les éléments proches du centre correspondent à la moyenne. Les éléments éloignés du centre sont les plus caractéristiques. Elle permet de traiter des variables quantitatives et qualitatives (ce qui n'est pas le cas de l'ACP).PROJECTION SUR LES AXES FACTORIELS
Le diagramme d' "Inertie" permet de voir sous forme d'histogramme le montant d'inertie(exprimée en %) de chaque facteur. Si les 2 premiers axes ont pour valeur propres cumulées un montant supérieur à 80%,une représentation en 2D en général suffit. Dans les autres cas,on choisit les axes factoriels en entrant leur numéro dans chaque boîte d'édition de la boîte de dialogue générale.
Projection du nuage des colonnes
Projection du nuage des lignes
Superposition Lignes et colonnes
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Last revised:05/2000