Protein-Ligand Docking,Molecular Modeling & Qsar
Les cours de modélisation moléculaire sont dispensés aux étudiants du Mastère
Chimie du Médicament (Innovations thérapeutiques) de la faculté de Pharmacie de Rennes.
Présentation générale et cours théoriques : 15Heures.
Les
Travaux-dirigés(exercises+projets) représentent environ 30 Heures et sont orientés réceptorologie.
Les
étudiants(es)se répartissent en binôme.
Le logiciel Prochemist est installé
sur 3 postes (PC Windows XP-PRO) durant toute la session.
La Photo du Prof
Site de
la faculté .
Cours 2004:Planning et Projets définis bientôt..
THEORIE
Modélisation moléculaire
La mécanique moléculaire
La Chimie quantique
La Dynamique moléculaire
Spectroscopie
Recherche de conformations
Interactions intramoléculaires(Liaisons hydrogéne..)
Interactions intermoléculaires(Docking)
Comparaison et Superposition
Lipophilie
Méthode de Hansch,Rekker,Bodor,Kantula..
Méthode du potentiel de lipophilie moléculaire
Calcul du Pka,LogD,solubilité...
Structure Activité
Les équations de Hansch
Les indices topologiques(Théorie des graphes)
Les indices de forme
Analyse de données
- Analyse qualitative
Analyse par composants principaux(ACP)
Analyse factorielle des correspondances(AFC)
Analyse Kohonen
- Analyse quantitative
Le Modéle linéaire
Regression multiple linéaire
Le modéle nonlinéaire
Réseaux de neurones
- Analyse combinatoire
Algorithmes génétiques
Application au Qsar
Choix des déscripteurs
Réceptorologie
Modélisation des proteines:spécificité des champs de force
Interactions Protéine-Protéine
Interactions Drogue-Récepteur
Bioinformatique
Chimiothéques
Le concept de similarite
Bases de données
Chimie&Biologie sur internet
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Last
revised:08/07/2004