Protein-Ligand Docking,Molecular Modeling & Qsar

Les cours de modélisation moléculaire sont dispensés aux étudiants du Mastère Chimie du Médicament (Innovations thérapeutiques) de la faculté de Pharmacie de Rennes.

Présentation générale et cours théoriques : 15Heures.
Les Travaux-dirigés(exercises+projets) représentent environ 30 Heures et sont orientés réceptorologie.
Les étudiants(es)se répartissent en binôme.
Le logiciel Prochemist est installé sur 3 postes (PC Windows XP-PRO) durant toute la session.

La Photo du Prof
Site de la faculté .
Cours 2004:Planning et Projets définis bientôt..


THEORIE


Modélisation moléculaire

La mécanique moléculaire
La Chimie quantique
La Dynamique moléculaire
Spectroscopie

Recherche de conformations

Interactions intramoléculaires(Liaisons hydrogéne..)
Interactions intermoléculaires(Docking)
Comparaison et Superposition

Lipophilie

Méthode de Hansch,Rekker,Bodor,Kantula..
Méthode du potentiel de lipophilie moléculaire
Calcul du Pka,LogD,solubilité...

Structure Activité

Les équations de Hansch
Les indices topologiques(Théorie des graphes)
Les indices de forme

Analyse de données

- Analyse qualitative
Analyse par composants principaux(ACP)
Analyse factorielle des correspondances(AFC)
Analyse Kohonen
- Analyse quantitative Le Modéle linéaire
Regression multiple linéaire Le modéle nonlinéaire
Réseaux de neurones
- Analyse combinatoire
Algorithmes génétiques
Application au Qsar
Choix des déscripteurs

Réceptorologie

Modélisation des proteines:spécificité des champs de force
Interactions Protéine-Protéine
Interactions Drogue-Récepteur
Bioinformatique

Chimiothéques

Le concept de similarite
Bases de données
Chimie&Biologie sur internet




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Last revised:08/07/2004